Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NapbP28663 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NapbP28663 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NapbP28663 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NapbP28663 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NapbP28663 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NapbP28663 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NapbP28663 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NapbP28663 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NapbP28663 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NapbP28663 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NapbP28663 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NapbP28663 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NapbP28663 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NapbP28663 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NapbP28663 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NapbP28663 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
NapbP28663 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NapbP28663 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NapbP28663 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NapbP28663 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NapbP28663 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NapbP28663 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NapbP28663 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NapbP28663 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NapbP28663 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NapbP28663 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NapbP28663 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NapbP28663 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NapbP28663 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NapbP28663 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NapbP28663 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NapbP28663 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NapbP28663 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NapbP28663 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NapbP28663 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NapbP28663 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NapbP28663 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NapbP28663 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NapbP28663 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NapbP28663 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NapbP28663 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NapbP28663 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NapbP28663 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NapbP28663 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NapbP28663 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NapbP28663 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NapbP28663 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NapbP28663 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NapbP28663 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NapbP28663 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NapbP28663 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NapbP28663 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NapbP28663 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NapbP28663 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NapbP28663 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NapbP28663 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NapbP28663 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NapbP28663 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NapbP28663 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms