Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa5P28312 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa5P28312 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa5P28312 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa5P28312 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa5P28312 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms