Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LoxP28301 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LoxP28301 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LoxP28301 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LoxP28301 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LoxP28301 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LoxP28301 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LoxP28301 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LoxP28301 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LoxP28301 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LoxP28301 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LoxP28301 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LoxP28301 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LoxP28301 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LoxP28301 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LoxP28301 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LoxP28301 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LoxP28301 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms