Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsgP28293 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms