Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb8P28063 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb8P28063 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb8P28063 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb8P28063 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb8P28063 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb8P28063 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb8P28063 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb8P28063 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb8P28063 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb8P28063 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb8P28063 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb8P28063 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb8P28063 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb8P28063 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb8P28063 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psmb8P28063 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb8P28063 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb8P28063 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms