Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenpbP27790 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenpbP27790 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenpbP27790 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenpbP27790 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenpbP27790 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenpbP27790 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenpbP27790 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CenpbP27790 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CenpbP27790 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CenpbP27790 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
CenpbP27790 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CenpbP27790 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CenpbP27790 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CenpbP27790 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms