Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lef1P27782 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lef1P27782 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms