Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af2P26369 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2af2P26369 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af2P26369 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af2P26369 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms