Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou2f1P25425 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou2f1P25425 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms