Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxd11P23813 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxd11P23813 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd11P23813 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
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