Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ggta1P23336 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ggta1P23336 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggta1P23336 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ggta1P23336 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ggta1P23336 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ggta1P23336 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Ggta1P23336 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Ggta1P23336 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ggta1P23336 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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