Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edn1P22387 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Edn1P22387 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms