Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tap1P21958 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tap1P21958 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tap1P21958 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tap1P21958 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tap1P21958 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms