Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb4P21440 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb4P21440 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb4P21440 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb4P21440 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb4P21440 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb4P21440 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb4P21440 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms