Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fcer1aP20489 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fcer1aP20489 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms