Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps6ka3P18654 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps6ka3P18654 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms