Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18528 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18528 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18528 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18528 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18528 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18528 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18528 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18528 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18528 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18528 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18528 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18528 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18528 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18528 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18528 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18528 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18528 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18528 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18528 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18528 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18528 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18528 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18528 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18528 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18528 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18528 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18528 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18528 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18528 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18528 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms