Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcl9P18340 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcl9P18340 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl9P18340 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl9P18340 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms