Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SellP18337 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SellP18337 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SellP18337 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SellP18337 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SellP18337 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SellP18337 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SellP18337 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SellP18337 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SellP18337 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SellP18337 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SellP18337 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SellP18337 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SellP18337 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SellP18337 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SellP18337 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SellP18337 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SellP18337 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms