Protein–RNA interactions for Protein: P18111

Cdx1, Homeobox protein CDX-1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx1P18111 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdx1P18111 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdx1P18111 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms