Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptbp1P17225 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms