Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnni2P13412 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnni2P13412 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni2P13412 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni2P13412 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni2P13412 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni2P13412 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni2P13412 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni2P13412 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni2P13412 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni2P13412 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni2P13412 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms