Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb2P13373 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb2P13373 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms