Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calb1P12658 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Calb1P12658 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb1P12658 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb1P12658 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Calb1P12658 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb1P12658 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms