Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd4P10628 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd4P10628 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms