Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsbP10605 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsbP10605 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsbP10605 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsbP10605 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsbP10605 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsbP10605 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CtsbP10605 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsbP10605 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsbP10605 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsbP10605 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsbP10605 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsbP10605 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms