Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P10404 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P10404 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
P10404 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P10404 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P10404 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P10404 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P10404 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P10404 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P10404 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P10404 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P10404 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P10404 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P10404 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P10404 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P10404 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P10404 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P10404 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P10404 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P10404 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P10404 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P10404 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P10404 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P10404 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P10404 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P10404 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P10404 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P10404 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P10404 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P10404 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P10404 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P10404 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P10404 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P10404 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P10404 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms