Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly6c1P0CW02 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly6c1P0CW02 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms