Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Igsf6P0C6B7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igsf6P0C6B7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms