Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hoxc9P09633 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc9P09633 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxc9P09633 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms