Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1P09055 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb1P09055 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms