Protein–RNA interactions for Protein: P09041

Pgk2, Phosphoglycerate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgk2P09041 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Pgk2P09041 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgk2P09041 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgk2P09041 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms