Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa5P09021 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms