Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NefmP08553 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NefmP08553 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NefmP08553 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NefmP08553 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NefmP08553 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NefmP08553 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NefmP08553 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NefmP08553 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NefmP08553 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NefmP08553 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NefmP08553 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NefmP08553 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NefmP08553 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NefmP08553 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NefmP08553 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NefmP08553 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NefmP08553 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NefmP08553 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NefmP08553 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
NefmP08553 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NefmP08553 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NefmP08553 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NefmP08553 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NefmP08553 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NefmP08553 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NefmP08553 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NefmP08553 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NefmP08553 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NefmP08553 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NefmP08553 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NefmP08553 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NefmP08553 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NefmP08553 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NefmP08553 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NefmP08553 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NefmP08553 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NefmP08553 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NefmP08553 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NefmP08553 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NefmP08553 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NefmP08553 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NefmP08553 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NefmP08553 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NefmP08553 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NefmP08553 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NefmP08553 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NefmP08553 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NefmP08553 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NefmP08553 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NefmP08553 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NefmP08553 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NefmP08553 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NefmP08553 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NefmP08553 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefmP08553 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefmP08553 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefmP08553 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefmP08553 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefmP08553 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefmP08553 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefmP08553 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NefmP08553 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NefmP08553 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NefmP08553 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NefmP08553 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NefmP08553 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NefmP08553 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NefmP08553 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NefmP08553 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NefmP08553 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NefmP08553 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NefmP08553 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NefmP08553 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NefmP08553 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NefmP08553 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NefmP08553 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NefmP08553 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NefmP08553 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NefmP08553 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NefmP08553 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms