Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spta1P08032 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spta1P08032 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spta1P08032 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spta1P08032 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms