Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mtnd1P03888 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mtnd1P03888 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mtnd1P03888 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms