Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01822 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01822 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01822 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
P01822 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01822 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01822 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01822 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01822 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01822 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01822 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01822 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01822 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01822 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01822 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01822 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01822 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01822 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01822 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01822 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01822 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01822 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01822 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01822 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01822 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01822 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01822 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01822 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01822 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01822 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01822 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01822 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01822 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms