Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01796 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01796 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01796 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01796 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01796 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01796 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01796 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01796 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01796 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01796 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01796 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01796 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01796 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01796 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01796 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01796 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01796 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01796 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01796 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01796 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01796 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01796 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01796 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01796 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01796 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01796 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms