Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01739 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01739 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01739 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01739 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01739 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01739 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01739 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01739 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01739 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01739 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01739 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01739 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01739 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01739 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01739 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01739 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01739 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01739 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01739 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01739 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms