Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01735 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01735 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01735 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01735 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01735 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01735 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01735 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01735 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01735 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01735 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01735 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01735 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01735 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01735 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01735 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01735 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01735 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01735 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01735 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01735 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01735 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01735 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01735 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01735 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01735 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01735 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01735 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms