Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01643 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01643 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01643 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01643 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01643 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01643 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01643 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01643 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01643 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01643 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01643 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01643 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01643 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms