Protein–RNA interactions for Protein: P01630

Ig kappa chain V-II region 7S34.1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01630 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01630 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01630 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01630 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01630 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01630 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01630 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01630 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01630 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01630 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01630 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01630 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01630 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01630 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01630 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01630 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01630 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01630 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01630 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01630 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms