Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mtatp6P00848 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms