Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lancl1O89112 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lancl1O89112 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms