Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Setdb1O88974 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setdb1O88974 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms