Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MscO88940 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MscO88940 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MscO88940 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MscO88940 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MscO88940 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MscO88940 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MscO88940 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MscO88940 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MscO88940 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MscO88940 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MscO88940 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MscO88940 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MscO88940 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MscO88940 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MscO88940 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MscO88940 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MscO88940 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MscO88940 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MscO88940 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MscO88940 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MscO88940 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MscO88940 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MscO88940 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms