Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tom1O88746 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tom1O88746 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tom1O88746 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tom1O88746 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tom1O88746 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms