Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pak1O88643 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pak1O88643 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1O88643 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms