Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30O88574 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sap30O88574 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sap30O88574 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sap30O88574 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms