Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cops3O88543 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops3O88543 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cops3O88543 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops3O88543 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms